Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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Rabgef1Q9JM13 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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Rabgef1Q9JM13 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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Rabgef1Q9JM13 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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Rabgef1Q9JM13 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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Rabgef1Q9JM13 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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