Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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