Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Usp29Q9ES63 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Usp29Q9ES63 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Usp29Q9ES63 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Usp29Q9ES63 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Usp29Q9ES63 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Usp29Q9ES63 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Usp29Q9ES63 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Usp29Q9ES63 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Usp29Q9ES63 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms