Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms