Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccdc47Q9D024 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 818 ms