Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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