Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ctu1Q99J10 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms