Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Prpf39Q8K2Z2 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Prpf39Q8K2Z2 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Prpf39Q8K2Z2 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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