Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms