Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Trim71Q1PSW8 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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