Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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ptchd1Q14B62 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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ptchd1Q14B62 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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ptchd1Q14B62 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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ptchd1Q14B62 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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ptchd1Q14B62 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
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ptchd1Q14B62 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
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ptchd1Q14B62 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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ptchd1Q14B62 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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ptchd1Q14B62 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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