Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Itgb8Q0VBD0 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Itgb8Q0VBD0 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms