Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtprmP28828 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtprmP28828 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PtprmP28828 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PtprmP28828 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PtprmP28828 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PtprmP28828 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PtprmP28828 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PtprmP28828 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PtprmP28828 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PtprmP28828 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PtprmP28828 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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