Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PdgfraP26618 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PdgfraP26618 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms