Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Sec22bO08547 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms