Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Snord8-201ENSMUST00000175303 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Mir466b-2-201ENSMUST00000103778 82 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm24185-201ENSMUST00000122578 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NebE9Q1W3 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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