Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.3 ms