Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
Grik3B1AS29 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Grik3B1AS29 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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