Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
PtprfA2A8L5 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129 ms