Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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Cldn8Q9Z260 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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Cldn8Q9Z260 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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Cldn8Q9Z260 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Cldn8Q9Z260 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Cldn8Q9Z260 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Cldn8Q9Z260 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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