Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 244.9 ms