Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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Rabgef1Q9JM13 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rabgef1Q9JM13 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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