Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RabggtaQ9JHK4 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RabggtaQ9JHK4 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms