Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn12Q9ET43 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms