Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc47Q9D024 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc47Q9D024 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
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