Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NubplQ9CWD8 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NubplQ9CWD8 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.4 ms