Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Rprd1bQ9CSU0 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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