Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Apobec3Q99J72 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Apobec3Q99J72 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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