Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ctu1Q99J10 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms