Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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Usp38Q8BW70 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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Usp38Q8BW70 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Usp38Q8BW70 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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