Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col4a5Q63ZW6 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms