Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Hoxa13Q62424 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms