Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Usp48Q3V0C5 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Usp48Q3V0C5 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Usp48Q3V0C5 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp48Q3V0C5 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp48Q3V0C5 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp48Q3V0C5 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Usp48Q3V0C5 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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Usp48Q3V0C5 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Usp48Q3V0C5 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Usp48Q3V0C5 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Usp48Q3V0C5 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Usp48Q3V0C5 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp48Q3V0C5 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp48Q3V0C5 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Usp48Q3V0C5 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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Usp48Q3V0C5 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Usp48Q3V0C5 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp48Q3V0C5 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp48Q3V0C5 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp48Q3V0C5 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp48Q3V0C5 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp48Q3V0C5 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp48Q3V0C5 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp48Q3V0C5 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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