Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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