Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Trim71Q1PSW8 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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