Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
ptchd1Q14B62 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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ptchd1Q14B62 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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ptchd1Q14B62 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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ptchd1Q14B62 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ptchd1Q14B62 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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