Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm13748-201ENSMUST00000149820 378 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Hoxd1Q01822 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms