Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rpl28P41105 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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