Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RxraP28700 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RxraP28700 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
RxraP28700 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RxraP28700 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RxraP28700 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RxraP28700 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RxraP28700 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RxraP28700 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RxraP28700 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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