Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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Vpreb1P13372 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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Vpreb1P13372 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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Vpreb1P13372 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Vpreb1P13372 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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