Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm23199-201ENSMUST00000158812 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mir7043-201ENSMUST00000184219 70 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm25254-201ENSMUST00000157239 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm22313-201ENSMUST00000158008 129 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm44351-201ENSMUST00000200090 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms