Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Cln8Q9QUK3 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Cln8Q9QUK3 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms