Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Rabgef1Q9JM13 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms