Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn12Q9ET43 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms