Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sgo1Q9CXH7 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sgo1Q9CXH7 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
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Sgo1Q9CXH7 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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Sgo1Q9CXH7 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Sgo1Q9CXH7 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
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Sgo1Q9CXH7 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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Sgo1Q9CXH7 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Sgo1Q9CXH7 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Sgo1Q9CXH7 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sgo1Q9CXH7 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sgo1Q9CXH7 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sgo1Q9CXH7 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sgo1Q9CXH7 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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