Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx28Q9CWT6 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms