Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Prpf39Q8K2Z2 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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