Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Usp38Q8BW70 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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