Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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