Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rbbp4Q60972 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rbbp4Q60972 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms